Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dgcr6O35347 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Dgcr6O35347 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms