Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smad6O35182 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smad6O35182 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smad6O35182 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smad6O35182 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Smad6O35182 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Smad6O35182 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Smad6O35182 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Smad6O35182 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Smad6O35182 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
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Smad6O35182 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Smad6O35182 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Smad6O35182 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smad6O35182 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smad6O35182 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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