Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3239L7N2D9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms