Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm8888J3QPX5 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm8888J3QPX5 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm8888J3QPX5 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm8888J3QPX5 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms