Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Myo5cE9Q1F5 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Myo5cE9Q1F5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Myo5cE9Q1F5 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms