Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc8E9PWG2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms