Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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