Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm45769-201ENSMUST00000204588 1828 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Samd1D3YXK1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms