Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms