Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rrn3B2RS91 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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