Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Znf518aB2RRF6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Znf518aB2RRF6 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Znf518aB2RRF6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Znf518aB2RRF6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Znf518aB2RRF6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Znf518aB2RRF6 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Znf518aB2RRF6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Znf518aB2RRF6 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Znf518aB2RRF6 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf518aB2RRF6 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf518aB2RRF6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf518aB2RRF6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf518aB2RRF6 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf518aB2RRF6 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms