Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prr16A3KMN5 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prr16A3KMN5 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prr16A3KMN5 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms