Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Lcn6A2AJB9 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Lcn6A2AJB9 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Lcn6A2AJB9 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Lcn6A2AJB9 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Lcn6A2AJB9 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Lcn6A2AJB9 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Lcn6A2AJB9 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Lcn6A2AJB9 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Lcn6A2AJB9 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Lcn6A2AJB9 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Lcn6A2AJB9 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Lcn6A2AJB9 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lcn6A2AJB9 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms