Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Mbd3Q9Z2D8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Mbd3Q9Z2D8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Mbd3Q9Z2D8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Mbd3Q9Z2D8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mbd3Q9Z2D8 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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