Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Pdpk1Q9Z2A0 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Pdpk1Q9Z2A0 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Pdpk1Q9Z2A0 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Pdpk1Q9Z2A0 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Pdpk1Q9Z2A0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Pdpk1Q9Z2A0 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Pdpk1Q9Z2A0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Pdpk1Q9Z2A0 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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