Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lgr5Q9Z1P4 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms