Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Phf1Q9Z1B8 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Phf1Q9Z1B8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Phf1Q9Z1B8 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Phf1Q9Z1B8 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phf1Q9Z1B8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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