Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Cldn13Q9Z0S4 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Cldn13Q9Z0S4 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Cldn13Q9Z0S4 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Cldn13Q9Z0S4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cldn13Q9Z0S4 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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