Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M3

Cdh20, Cadherin-20, mousemouse

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Length 801 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh20Q9Z0M3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdh20Q9Z0M3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdh20Q9Z0M3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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