Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TapbpQ9R233 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms