Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nphp1Q9QY53 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms