Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF1

Gabrq, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit theta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabrqQ9JLF1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
GabrqQ9JLF1 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GabrqQ9JLF1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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