Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Chrac1Q9JKP8 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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