Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
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Usp29Q9ES63 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
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Usp29Q9ES63 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Usp29Q9ES63 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Usp29Q9ES63 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
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Usp29Q9ES63 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp29Q9ES63 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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