Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clstn1Q9EPL2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms