Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Syde1Q9DBZ9 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms