Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SlirpQ9D8T7 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms