Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tmigd1Q9D7L8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms