Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Pramef12Q9D2F1 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Pramef12Q9D2F1 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Pramef12Q9D2F1 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Pramef12Q9D2F1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms