Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Spns3Q9D232 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Spns3Q9D232 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Spns3Q9D232 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Spns3Q9D232 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Spns3Q9D232 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 314.8 ms