Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Zbed3Q9D0L1 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbed3Q9D0L1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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