Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2e1Q9D0D5 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms