Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms