Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms