Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxxc1Q9CWW7 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxxc1Q9CWW7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxxc1Q9CWW7 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxxc1Q9CWW7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxxc1Q9CWW7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxxc1Q9CWW7 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxxc1Q9CWW7 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cxxc1Q9CWW7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cxxc1Q9CWW7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cxxc1Q9CWW7 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cxxc1Q9CWW7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cxxc1Q9CWW7 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cxxc1Q9CWW7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cxxc1Q9CWW7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cxxc1Q9CWW7 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Cxxc1Q9CWW7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cxxc1Q9CWW7 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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