Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp2Q9CQ73 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp2Q9CQ73 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp2Q9CQ73 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp2Q9CQ73 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pkp2Q9CQ73 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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