Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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