Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1b4Q99ME6 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms