Protein–RNA interactions for Protein: Q99KV1

Dnajb11, DnaJ homolog subfamily B member 11, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb11Q99KV1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Dnajb11Q99KV1 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Dnajb11Q99KV1 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Dnajb11Q99KV1 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Dnajb11Q99KV1 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Dnajb11Q99KV1 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Dnajb11Q99KV1 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Dnajb11Q99KV1 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Dnajb11Q99KV1 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Dnajb11Q99KV1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Dnajb11Q99KV1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Dnajb11Q99KV1 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Dnajb11Q99KV1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Dnajb11Q99KV1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Dnajb11Q99KV1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Dnajb11Q99KV1 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Dnajb11Q99KV1 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Dnajb11Q99KV1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Dnajb11Q99KV1 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Dnajb11Q99KV1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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