Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ciao1Q99KN2 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ciao1Q99KN2 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ciao1Q99KN2 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ciao1Q99KN2 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ciao1Q99KN2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ciao1Q99KN2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ciao1Q99KN2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ciao1Q99KN2 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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