Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubxn2aQ99KJ0 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms