Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lims1Q99JW4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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