Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms