Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Apobec3Q99J72 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Apobec3Q99J72 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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