Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Klhdc3Q8VEM9 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Klhdc3Q8VEM9 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Klhdc3Q8VEM9 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Klhdc3Q8VEM9 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Klhdc3Q8VEM9 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Klhdc3Q8VEM9 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Klhdc3Q8VEM9 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Klhdc3Q8VEM9 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Klhdc3Q8VEM9 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Klhdc3Q8VEM9 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Klhdc3Q8VEM9 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Klhdc3Q8VEM9 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Klhdc3Q8VEM9 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Klhdc3Q8VEM9 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Klhdc3Q8VEM9 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Klhdc3Q8VEM9 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Klhdc3Q8VEM9 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Klhdc3Q8VEM9 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Klhdc3Q8VEM9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Klhdc3Q8VEM9 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Klhdc3Q8VEM9 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Klhdc3Q8VEM9 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Klhdc3Q8VEM9 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Klhdc3Q8VEM9 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms