Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Rdh10Q8VCH7 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Rdh10Q8VCH7 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Rdh10Q8VCH7 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Rdh10Q8VCH7 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rdh10Q8VCH7 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rdh10Q8VCH7 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rdh10Q8VCH7 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rdh10Q8VCH7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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