Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms