Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup88Q8CEC0 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms