Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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