Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms